USB または MIDI キーボードコントローラを使って演奏する場合は、ソフトウェア音源付きの MainStage パッチをコントローラを使用して演奏したり制御したりできます。キーボードコントローラ上のフェーダー、ノブ、ボタンなどのコントロールをコンサートのスクリーンコントロールにアサインしてから、それらのスクリーンコントロールをパッチのパラメータにマップできます。すぐに使いたいパラメータだけをパッチごとに選択しておけば、演奏中にコントローラから呼び出すことができます。
サスティンペダル、エクスプレッションペダル、フットスイッチ、MIDI ギター、ウィンドコントローラなどの標準 MIDI メッセージを送信する MIDI コントローラを使って、「MainStage」を操作できます。外部ハードウェアシンセサイザーや ReWire アプリケーションなどの仮想音源を外部音源チャンネルストリップを使って制御することもできます。