Motion プロジェクトには、複数のイメージレイヤーと適用したエフェクトから成る 1 つのコンポジションが含まれます。プロジェクトに静止画像やビデオクリップを読み込むと、ディスク上のソース・メディア・ファイルにリンクした参照が作成されますが、元のファイルが移動、複製、変更されることはありません。Motion プロジェクトファイルには、コンポジションをどのように組み立てるのか、ディスク上のどのメディアファイルを使用するのか、「ライブラリ」のどのエフェクトを適用するのかなどの情報が格納されています。プロジェクトファイルには、読み込んだメディアに加えて、アプリケーションで作成するシェイプ、マスク、テキストレイヤーも含まれています。